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虽然赤木律子讲的好象很多，但总体来说就是那么些事——很久以前，某个外星天体携带着莉莉丝降临地球，与地球原本就存在的亚当发生接触，爆发了第一次冲击，碎片上升太空形成了月球，融合的两者诞生出生命之树与十八使徒，只不过因为生命之树本身孕育的果实的数量有限，最后只有早出生的那几位率先吃到了生命之果，最后的使徒（李林）只能吃剩下的智慧之果。
但既然叫做智慧之果，那么力量上自然和生命之果有所不同，所以最后的使徒李林因为力量不足的关系无法再维持住AT力场保有住现有的型体，分散成了‘群’，形成了星球上的霸主——人类。
而完成了孕育使命的生命之树也因为精华的耗尽，迅速枯萎，只留下一截残枝形成了拥有让所有使徒力量回归如初的朗基奴斯长枪。
然后消耗掉了一定力量的亚当和莉莉丝开始沉睡，任由新诞生的人类茫然的生活在那片蛮荒的世界上……直到1947年，一些吉普赛人偶然在约`旦溪谷的洞窟中发现了死海文书，这才算是解开自身的诞生之迷。但也在同时，让人类知道了一个可怕的事实，那就是当某个时间到来时，亚当所生的使徒会回归‘白之月’，莉莉丝所生的使徒会回归‘黑之月’，重新生长出生命之树并产生新形态的生命体。
这也是亚当为什么会被称为第一使徒，莉莉丝被称为第二使徒的原因。
而其中若亚当的使徒率先回归，将引发撞击，作为代价。另一方的后代将获得死亡！反之若是另一方回归莉莉丝，也会成为新生命形态。尽管最后的结果也是死，但灵魂将得到拯救。因此在这个约定时刻到来之前，人类要想顺利完成回归，就必须在此之前消灭全部的使徒。
这才是人类必须要和使徒战斗的根本原因。为了活下去！
只不过在这过程中。一群宗`教疯子却想要连最后一步也要进行下去，让全部的人类融合成一体，形成新的生命体——全灵。亦或者神，永恒的在宇宙中存活下去，用以来证明人类曾经存在过的痕迹，由此通过有着共同愿望的人建立了极机密组织SEELE，并制定出了所谓的‘人类补完计划’。
然而想要完好、顺利的实行‘人类补完计划’。那么作为第一使徒的亚当就必须要控制在自己的手里才行！所以为了这一目的，计划的重要参与者及设计人之一的碇唯，明日香的母亲、冬月副司令便是这个时候加入SEELE的。
同理的还有葛城美里的父亲，赤木律子的母亲等，只不过所负责的项目并不相同罢了。
而其中葛城美里的父亲，理论推倒出了S2机关存在形式的葛城博士所负
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